九州と四国を分ける豊後(ぶんご)水道(すいどう)の孤島、水ノ子島に位置する高さ４１ｍの洋式灯台で、艦船の航行が増加する中、水道の重要な目標として設置された航路標識である。設計監理を逓信省(ていしんしょう)航路標識管理所が担い、明治３４年３月に着工、明治３７年３月に竣工した。灯塔は外側が石造、内側が煉瓦(れんが)造の二重壁構造をもつ。内部は９層からなり、上部２層を鉄製とする点や、灯塔内に貯水槽や燃料室、詰員寝室を備える点は独特である。豊後水道の岩礁上という厳しい条件下にあって、必要な施設を備える工夫が見られ、近代航路標識整備の展開を知る上で価値が高い。対岸となる佐伯市の鶴見半島に建設された旧吏員退息所と旧物置所も当初の姿を伝え、あわせて保存を図る。